Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vat1Q62465 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms