Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms