Protein–RNA interactions for Protein: Q62231

Six1, Homeobox protein SIX1, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six1Q62231 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six1Q62231 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six1Q62231 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six1Q62231 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six1Q62231 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six1Q62231 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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Six1Q62231 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Six1Q62231 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Six1Q62231 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Six1Q62231 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six1Q62231 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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