Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms