Protein–RNA interactions for Protein: Q62192

Cd180, CD180 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd180Q62192 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd180Q62192 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.5 ms