Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssr4Q62186 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms