Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms