Protein–RNA interactions for Protein: Q61660

Foxj1, Forkhead box protein J1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxj1Q61660 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxj1Q61660 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms