Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms