Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcd1Q61466 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms