Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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PcolceQ61398 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcolceQ61398 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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