Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms