Protein–RNA interactions for Protein: Q61233

Lcp1, Plastin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcp1Q61233 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms