Protein–RNA interactions for Protein: Q61068

Usp17la, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein A, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17laQ61068 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Usp17laQ61068 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Usp17laQ61068 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Usp17laQ61068 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Usp17laQ61068 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Usp17laQ61068 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Usp17laQ61068 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Usp17laQ61068 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Usp17laQ61068 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms