Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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Slc6a4Q60857 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Slc6a4Q60857 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Slc6a4Q60857 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Slc6a4Q60857 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Slc6a4Q60857 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Slc6a4Q60857 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Slc6a4Q60857 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Slc6a4Q60857 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Slc6a4Q60857 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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