Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms