Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms