Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms