Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CttnQ60598 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CttnQ60598 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CttnQ60598 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CttnQ60598 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CttnQ60598 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CttnQ60598 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CttnQ60598 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CttnQ60598 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms