Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms