Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Trim38Q5SZ99 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Trim38Q5SZ99 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Trim38Q5SZ99 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Trim38Q5SZ99 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Trim38Q5SZ99 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Trim38Q5SZ99 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Trim38Q5SZ99 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Trim38Q5SZ99 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim38Q5SZ99 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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