Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms