Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms