Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms