Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scarf1Q5ND28 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms