Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms