Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vps41Q5KU39 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms