Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc8bQ5DU41 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms