Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTU0

Afap1l2, Actin filament-associated protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afap1l2Q5DTU0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afap1l2Q5DTU0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms