Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKS4

Eri2, ERI1 exoribonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eri2Q5BKS4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eri2Q5BKS4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms