Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Znf354cQ571J5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms