Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrc47Q505F5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc47Q505F5 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms