Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms