Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhox3aQ4TU90 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms