Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms