Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ckap2Q3V1H1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ckap2Q3V1H1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ckap2Q3V1H1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ckap2Q3V1H1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ckap2Q3V1H1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ckap2Q3V1H1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ckap2Q3V1H1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ckap2Q3V1H1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ckap2Q3V1H1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ckap2Q3V1H1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ckap2Q3V1H1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ckap2Q3V1H1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ckap2Q3V1H1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ckap2Q3V1H1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ckap2Q3V1H1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms