Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ulk4Q3V129 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms