Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc185Q3V118 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc185Q3V118 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc185Q3V118 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc185Q3V118 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc185Q3V118 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc185Q3V118 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc185Q3V118 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc185Q3V118 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc185Q3V118 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms