Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0U0

1700057G04Rik, Phospholipid scramblase, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700057G04RikQ3V0U0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700057G04RikQ3V0U0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700057G04RikQ3V0U0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700057G04RikQ3V0U0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700057G04RikQ3V0U0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700057G04RikQ3V0U0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700057G04RikQ3V0U0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700057G04RikQ3V0U0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700057G04RikQ3V0U0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700057G04RikQ3V0U0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
1700057G04RikQ3V0U0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700057G04RikQ3V0U0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700057G04RikQ3V0U0 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700057G04RikQ3V0U0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700057G04RikQ3V0U0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700057G04RikQ3V0U0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700057G04RikQ3V0U0 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700057G04RikQ3V0U0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700057G04RikQ3V0U0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700057G04RikQ3V0U0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700057G04RikQ3V0U0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700057G04RikQ3V0U0 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700057G04RikQ3V0U0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700057G04RikQ3V0U0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700057G04RikQ3V0U0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700057G04RikQ3V0U0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700057G04RikQ3V0U0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700057G04RikQ3V0U0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700057G04RikQ3V0U0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700057G04RikQ3V0U0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700057G04RikQ3V0U0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
1700057G04RikQ3V0U0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
1700057G04RikQ3V0U0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700057G04RikQ3V0U0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms