Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms