Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Pfdn4Q3UWL8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Pfdn4Q3UWL8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Pfdn4Q3UWL8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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