Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms