Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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