Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TceancQ3US16 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms