Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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