Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp30Q3UN04 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms