Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms