Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF3

Mier3, Mesoderm induction early response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier3Q3UHF3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mier3Q3UHF3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mier3Q3UHF3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mier3Q3UHF3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mier3Q3UHF3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mier3Q3UHF3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mier3Q3UHF3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mier3Q3UHF3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mier3Q3UHF3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mier3Q3UHF3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Mier3Q3UHF3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mier3Q3UHF3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mier3Q3UHF3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mier3Q3UHF3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mier3Q3UHF3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mier3Q3UHF3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mier3Q3UHF3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mier3Q3UHF3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mier3Q3UHF3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms