Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.8 ms