Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Parp8Q3UD82 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms